故事发生在一个被神秘巨龙威胁的世界。一种名为“龙”的怪物突然出现，它们拥有强大的破坏力，不断侵蚀人类的领土，令文明陷入存亡危机。为对抗这些天灾，一群被称为“Type Dragon”的少女们觉醒了超能力，她们是唯一能与龙抗衡的存在。男主角物部悠平，曾是特殊部队成员，因故转入专门培养Type Dragon的米德加尔学园，成为其中唯一的男性。学园内，少女们各自拥有不同的元素能力，但彼此间关系复杂，既有信赖也有隔阂。悠平凭借战斗经验与冷静判断，逐渐赢得她们的信任，并揭开龙出现的真相。随着剧情推进，悠平发现“龙”并非单纯的外敌，其背后隐藏着人类与龙族的历史纠葛，以及一位神秘少女“伊莉丝”的过去。在与龙的多次交战中，悠平与少女们不断突破极限，面对内心恐惧与羁绊，最终为守护所爱之人，踏上对抗命运终局的决战之路。