450年前，宇宙霸主哈迪斯大帝率军侵略银河，最终被幻神星人娜伦以史特拉石碑阵封印。然而，450年后的现代，哈迪斯的忠实部下佐拉博士企图复活大帝，派遣机动骑士与宇宙巨兽不断袭击地球，世界陷入新的危机。就在此时，沉睡的幻星神兽雷零守感应到邪恶气息而苏醒，并选中了三位性格迥异的少年少女——剑道少年星野刚、热血运动少年飞鸟零、以及温柔少女月代香，赋予他们变身幻星神的力量。三人组成幻星神战队，驾驶由雷零守变形而成的巨大战机“幻星神机”，与机动骑士和宇宙巨兽展开激烈战斗。随着战斗深入，他们逐渐揭开哈迪斯大帝与娜伦之间的古老恩怨，以及自身命运背后的真相。面对强大的敌人和内心的迷茫，三位幻星神在友情与信任中不断成长，最终集结所有幻星神兽的力量，向哈迪斯大帝发动终极决战，守护地球与宇宙的安宁。