《萌菌物语》改编自同名漫画，讲述了农业大学新生泽木惣右卫门直保的奇妙校园生活。直保天生具备特殊能力——他不仅能看见空气中漂浮的细菌，还能徒手抓住它们并与它们交流。这一能力在农业领域堪称“神技”，让他能轻松辨识各种微生物的特性与作用。然而，能力带来的并非全是便利。直保时常因与菌类对话而陷入尴尬境地，加上性格内向，他在人际交往中屡屡受挫。幸好有青梅竹马的好友结城萤和学长川滨拓马等人的帮助，直保逐渐适应了大学生活。故事以轻松幽默的方式展现了微生物世界的奥秘，从发酵、酿造到食物腐败，每个日常现象背后都藏着菌类的奇妙故事。直保在解决各种与菌相关的问题时，也收获了友情与成长。这部作品不仅科普了微生物知识，更传递了尊重自然、热爱生活的理念，是一部兼具趣味性与教育意义的校园喜剧。