《人机续篇》以少女津崎青叶的命运转折为起点，她在奶奶去世后不久被神秘势力绑架，醒来时已身处南美洲委内瑞拉的隐秘组织“安贝尔”。该组织正秘密研发一种名为“人机”的巨型作战兵器，而青叶竟被选中成为其驾驶员，被迫卷入一场关乎世界存亡的战争。在训练与战斗中，青叶结识了同样被选中的少女黄坂蕾，两人从陌生到默契，逐渐建立起深厚的友谊。然而，一个名为“虚无”的恐怖组织悄然崛起，他们操控人机对多个国家发动突袭，制造出令整座城镇凭空消失的“lost life现象”，全球陷入恐慌与混乱。面对强大的敌人与残酷的现实，青叶和蕾不仅要驾驭人机对抗“虚无”的进攻，还要揭开人机技术背后的秘密，以及自己与这场战争之间的宿命关联。随着战斗升级，她们发现“虚无”的目标远超想象，而“安贝尔”内部也暗藏阴谋。在一次次生死考验中，青叶逐渐成长，她必须直面内心的恐惧与迷茫，找到属于自己的战斗意义，为守护所爱之人与世界的未来而战。