《闪电超人》讲述东南大学三年级学生渡五郎与好友丸目豪作，某夜目击怪人袭击一名女子和少年。两人挺身而出，却因实力悬殊被反击，五郎不幸坠入大海。醒来后，五郎发现被救的女子和少年正与同伴守候，向他揭示惊人真相：袭击他们的怪人隶属神秘组织“新人类帝国”，意图征服世界。为对抗这一威胁，五郎与这群拥有特殊能力的伙伴组成“突变少年同盟”，共同投身战斗。五郎在战斗中逐渐觉醒自身潜能，掌握闪电般的力量，成为团队核心战力。面对新人类帝国层出不穷的怪人与阴谋，同盟成员团结协作，以勇气和智慧迎击强敌。在一次次生死交锋中，五郎不仅磨炼了能力，更深刻理解了责任与友情。他必须在新人类帝国的步步紧逼下，守护身边之人，揭开组织背后的终极秘密，为世界带来和平。